MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_014002	TCT	2	6	1981043	1981048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496652
33502	NC_014002	AAC	2	6	1981153	1981158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496652
33503	NC_014002	GTA	2	6	1981186	1981191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496652
33504	NC_014002	TCT	2	6	1981238	1981243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496652
33505	NC_014002	CTG	2	6	1981300	1981305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496652
33506	NC_014002	CTG	2	6	1981364	1981369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496652
33507	NC_014002	ATC	2	6	1981405	1981410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496652
33508	NC_014002	TAC	2	6	1981414	1981419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496652
33509	NC_014002	CAG	2	6	1981464	1981469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496652
33510	NC_014002	GTT	2	6	1981472	1981477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496652
33511	NC_014002	CTG	2	6	1981518	1981523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496652
33512	NC_014002	TTG	2	6	1981554	1981559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496652
33513	NC_014002	TCAT	2	8	1981571	1981578	25 %	50 %	0 %	25 %	294496652
33514	NC_014002	TCA	2	6	1981607	1981612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496652
33515	NC_014002	TAT	2	6	1981653	1981658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496652
33516	NC_014002	CTG	2	6	1981698	1981703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496652
33517	NC_014002	CAT	2	6	1982591	1982596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496653
33518	NC_014002	GAG	2	6	1982607	1982612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496653
33519	NC_014002	ATG	2	6	1982637	1982642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496653
33520	NC_014002	GGA	2	6	1982669	1982674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496653
33521	NC_014002	AAT	2	6	1982690	1982695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496653
33522	NC_014002	TTCC	2	8	1982722	1982729	0 %	50 %	0 %	50 %	294496653
33523	NC_014002	ATG	2	6	1982772	1982777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496653
33524	NC_014002	ATC	2	6	1982784	1982789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496653
33525	NC_014002	CA	3	6	1982792	1982797	50 %	0 %	0 %	50 %	294496653
33526	NC_014002	AG	3	6	1982815	1982820	50 %	0 %	50 %	0 %	294496653
33527	NC_014002	CATC	2	8	1982839	1982846	25 %	25 %	0 %	50 %	294496653
33528	NC_014002	GCC	2	6	1982865	1982870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496653
33529	NC_014002	CAC	2	6	1982900	1982905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496653
33530	NC_014002	AAT	2	6	1982912	1982917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496653
33531	NC_014002	TGA	2	6	1982932	1982937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496653
33532	NC_014002	ATC	2	6	1982946	1982951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496653
33533	NC_014002	CTA	2	6	1983014	1983019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496653
33534	NC_014002	CCGCAG	2	12	1983038	1983049	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294496653
33535	NC_014002	AAG	2	6	1983115	1983120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496653
33536	NC_014002	ATCC	2	8	1983129	1983136	25 %	25 %	0 %	50 %	294496653
33537	NC_014002	GAA	2	6	1983141	1983146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496653
33538	NC_014002	AAGC	2	8	1983295	1983302	50 %	0 %	25 %	25 %	294496654
33539	NC_014002	AGC	2	6	1983320	1983325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33540	NC_014002	CATA	2	8	1983337	1983344	50 %	25 %	0 %	25 %	294496654
33541	NC_014002	A	6	6	1983402	1983407	100 %	0 %	0 %	0 %	294496654
33542	NC_014002	ACC	2	6	1983471	1983476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496654
33543	NC_014002	CAGC	2	8	1983511	1983518	25 %	0 %	25 %	50 %	294496654
33544	NC_014002	CCA	2	6	1983568	1983573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496654
33545	NC_014002	CCA	2	6	1983577	1983582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496654
33546	NC_014002	TGCC	2	8	1983595	1983602	0 %	25 %	25 %	50 %	294496654
33547	NC_014002	TCA	2	6	1983637	1983642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496654
33548	NC_014002	TCC	2	6	1983645	1983650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496654
33549	NC_014002	CAG	2	6	1983749	1983754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33550	NC_014002	AAT	2	6	1983776	1983781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496654
33551	NC_014002	AT	3	6	1983833	1983838	50 %	50 %	0 %	0 %	294496654
33552	NC_014002	ATC	2	6	1983881	1983886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496654
33553	NC_014002	GCA	2	6	1983889	1983894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33554	NC_014002	ACTGG	2	10	1983902	1983911	20 %	20 %	40 %	20 %	294496654
33555	NC_014002	CAT	2	6	1983976	1983981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496654
33556	NC_014002	CTGC	2	8	1984018	1984025	0 %	25 %	25 %	50 %	294496654
33557	NC_014002	CTG	2	6	1984049	1984054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33558	NC_014002	AGC	2	6	1984103	1984108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33559	NC_014002	CTC	2	6	1984118	1984123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496654
33560	NC_014002	TTC	2	6	1984127	1984132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496654
33561	NC_014002	GGAA	2	8	1984193	1984200	50 %	0 %	50 %	0 %	294496654
33562	NC_014002	TGCCAT	2	12	1984322	1984333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294496654
33563	NC_014002	AAGC	2	8	1984429	1984436	50 %	0 %	25 %	25 %	294496654
33564	NC_014002	C	6	6	1984567	1984572	0 %	0 %	0 %	100 %	294496654
33565	NC_014002	TCA	2	6	1984588	1984593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496654
33566	NC_014002	TC	3	6	1984628	1984633	0 %	50 %	0 %	50 %	294496654
33567	NC_014002	GCC	3	9	1984677	1984685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496654
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33569	NC_014002	C	6	6	1984765	1984770	0 %	0 %	0 %	100 %	294496654
33570	NC_014002	TTC	2	6	1984808	1984813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496654
33571	NC_014002	AACCCG	2	12	1984846	1984857	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294496654
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33575	NC_014002	CGG	2	6	1985119	1985124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496654
33576	NC_014002	AGCC	2	8	1985141	1985148	25 %	0 %	25 %	50 %	294496654
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33579	NC_014002	CCT	2	6	1985250	1985255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496654
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33581	NC_014002	GTT	2	6	1985395	1985400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496654
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33583	NC_014002	GA	3	6	1985543	1985548	50 %	0 %	50 %	0 %	294496654
33584	NC_014002	CAG	2	6	1985588	1985593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33585	NC_014002	AACA	2	8	1985597	1985604	75 %	0 %	0 %	25 %	294496654
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33588	NC_014002	GCT	3	9	1985664	1985672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496654
33589	NC_014002	TTC	2	6	1985694	1985699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496654
33590	NC_014002	TTCTCT	2	12	1985733	1985744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496654
33591	NC_014002	ATC	2	6	1985792	1985797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496654
33592	NC_014002	AAAC	2	8	1986000	1986007	75 %	0 %	0 %	25 %	294496655
33593	NC_014002	A	6	6	1986039	1986044	100 %	0 %	0 %	0 %	294496655
33594	NC_014002	ATT	2	6	1986056	1986061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496655
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33598	NC_014002	AGC	2	6	1986454	1986459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496655
33599	NC_014002	GCAT	2	8	1986476	1986483	25 %	25 %	25 %	25 %	294496655
33600	NC_014002	GAA	2	6	1986547	1986552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496655
33601	NC_014002	ACAG	2	8	1986626	1986633	50 %	0 %	25 %	25 %	294496655
33602	NC_014002	TAT	2	6	1986646	1986651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496655
33603	NC_014002	TCA	2	6	1986653	1986658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496655
33604	NC_014002	CAT	2	6	1986676	1986681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496655
33605	NC_014002	CAAAAC	2	12	1986783	1986794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496655
33606	NC_014002	A	6	6	1986796	1986801	100 %	0 %	0 %	0 %	294496655
33607	NC_014002	AGC	3	9	1986829	1986837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496655
33608	NC_014002	T	6	6	1986866	1986871	0 %	100 %	0 %	0 %	294496655
33609	NC_014002	CAG	2	6	1986922	1986927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496655
33610	NC_014002	TAA	2	6	1986994	1986999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496655
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33612	NC_014002	AAT	2	6	1987078	1987083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496655
33613	NC_014002	CA	3	6	1987186	1987191	50 %	0 %	0 %	50 %	294496656
33614	NC_014002	ATT	2	6	1987217	1987222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496656
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